Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Capns2Q9D7J7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capns2Q9D7J7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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