Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfsf13Q9D777 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms