Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D727 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D727 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D727 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D727 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D727 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D727 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D727 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D727 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D727 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D727 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D727 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D727 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D727 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D727 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D727 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D727 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D727 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D727 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D727 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D727 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D727 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D727 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D727 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D727 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D727 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D727 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D727 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D727 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D727 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D727 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D727 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D727 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D727 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D727 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D727 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D727 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D727 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D727 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D727 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D727 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D727 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D727 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D727 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D727 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D727 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D727 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D727 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D727 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D727 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D727 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D727 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D727 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D727 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D727 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D727 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D727 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D727 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D727 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D727 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D727 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D727 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D727 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D727 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D727 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D727 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D727 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D727 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D727 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D727 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D727 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D727 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D727 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D727 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D727 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D727 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D727 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D727 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D727 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D727 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D727 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D727 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D727 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D727 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D727 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D727 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D727 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D727 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D727 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D727 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D727 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D727 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D727 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D727 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D727 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D727 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D727 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D727 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D727 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D727 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms