Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpap3Q9D706 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpap3Q9D706 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms