Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tubb4aQ9D6F9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms