Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc130Q9D516 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms