Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PrameQ9D4Z5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms