Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930578G10RikQ9D4Q4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930578G10RikQ9D4Q4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930578G10RikQ9D4Q4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930578G10RikQ9D4Q4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.31■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms