Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lonrf3Q9D4H7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms