Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sohlh2Q9D489 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms