Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933428M09RikQ9D3X3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms