Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Stag1Q9D3E6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stag1Q9D3E6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stag1Q9D3E6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms