Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rufy3Q9D394 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms