Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snrnp35Q9D384 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms