Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q9D2Q3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D2Q3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms