Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1M0

Sec13, Protein SEC13 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec13Q9D1M0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sec13Q9D1M0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec13Q9D1M0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec13Q9D1M0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec13Q9D1M0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec13Q9D1M0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec13Q9D1M0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec13Q9D1M0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec13Q9D1M0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec13Q9D1M0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec13Q9D1M0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec13Q9D1M0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec13Q9D1M0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec13Q9D1M0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sec13Q9D1M0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sec13Q9D1M0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sec13Q9D1M0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms