Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cysrt1Q9D1E4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cysrt1Q9D1E4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cysrt1Q9D1E4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cysrt1Q9D1E4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cysrt1Q9D1E4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cysrt1Q9D1E4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cysrt1Q9D1E4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cysrt1Q9D1E4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cysrt1Q9D1E4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cysrt1Q9D1E4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cysrt1Q9D1E4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cysrt1Q9D1E4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cysrt1Q9D1E4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cysrt1Q9D1E4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cysrt1Q9D1E4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cysrt1Q9D1E4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cysrt1Q9D1E4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cysrt1Q9D1E4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cysrt1Q9D1E4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cysrt1Q9D1E4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cysrt1Q9D1E4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cysrt1Q9D1E4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cysrt1Q9D1E4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cysrt1Q9D1E4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cysrt1Q9D1E4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms