Protein–RNA interactions for Protein: Q9D110

Mthfs, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MthfsQ9D110 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MthfsQ9D110 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MthfsQ9D110 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MthfsQ9D110 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms