Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snu13Q9D0T1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snu13Q9D0T1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snu13Q9D0T1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snu13Q9D0T1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snu13Q9D0T1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snu13Q9D0T1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snu13Q9D0T1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snu13Q9D0T1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snu13Q9D0T1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snu13Q9D0T1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snu13Q9D0T1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snu13Q9D0T1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snu13Q9D0T1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snu13Q9D0T1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snu13Q9D0T1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snu13Q9D0T1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snu13Q9D0T1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snu13Q9D0T1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snu13Q9D0T1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snu13Q9D0T1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snu13Q9D0T1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snu13Q9D0T1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snu13Q9D0T1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snu13Q9D0T1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snu13Q9D0T1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snu13Q9D0T1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snu13Q9D0T1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snu13Q9D0T1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snu13Q9D0T1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snu13Q9D0T1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snu13Q9D0T1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snu13Q9D0T1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snu13Q9D0T1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snu13Q9D0T1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snu13Q9D0T1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms