Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfc5Q9D0F6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfc5Q9D0F6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfc5Q9D0F6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfc5Q9D0F6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfc5Q9D0F6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfc5Q9D0F6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfc5Q9D0F6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfc5Q9D0F6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfc5Q9D0F6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfc5Q9D0F6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms