Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cmss1Q9CZT6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmss1Q9CZT6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmss1Q9CZT6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms