Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snf8Q9CZ28 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms