Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssbp2Q9CYZ8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssbp2Q9CYZ8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssbp2Q9CYZ8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssbp2Q9CYZ8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssbp2Q9CYZ8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssbp2Q9CYZ8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssbp2Q9CYZ8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssbp2Q9CYZ8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ssbp2Q9CYZ8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ssbp2Q9CYZ8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssbp2Q9CYZ8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssbp2Q9CYZ8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms