Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prelid3bQ9CYY7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Prelid3bQ9CYY7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 622.9 ms