Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gins3Q9CY94 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms