Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms