Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pin4Q9CWW6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pin4Q9CWW6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pin4Q9CWW6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pin4Q9CWW6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pin4Q9CWW6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pin4Q9CWW6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pin4Q9CWW6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pin4Q9CWW6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pin4Q9CWW6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pin4Q9CWW6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pin4Q9CWW6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pin4Q9CWW6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pin4Q9CWW6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pin4Q9CWW6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pin4Q9CWW6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pin4Q9CWW6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pin4Q9CWW6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pin4Q9CWW6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pin4Q9CWW6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pin4Q9CWW6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pin4Q9CWW6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pin4Q9CWW6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pin4Q9CWW6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pin4Q9CWW6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms