Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BccipQ9CWI3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BccipQ9CWI3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms