Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gnpda2Q9CRC9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gnpda2Q9CRC9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gnpda2Q9CRC9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gnpda2Q9CRC9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gnpda2Q9CRC9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gnpda2Q9CRC9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gnpda2Q9CRC9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gnpda2Q9CRC9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gnpda2Q9CRC9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms