Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CRC3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CRC3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CRC3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CRC3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRC3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRC3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRC3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRC3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CRC3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CRC3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CRC3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CRC3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CRC3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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