Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700029F12RikQ9CRB4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms