Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR63

Cox16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox16Q9CR63 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cox16Q9CR63 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cox16Q9CR63 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms