Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tma16Q9CR02 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tma16Q9CR02 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tma16Q9CR02 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tma16Q9CR02 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tma16Q9CR02 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tma16Q9CR02 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tma16Q9CR02 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tma16Q9CR02 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tma16Q9CR02 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.6 ms