Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chchd5Q9CQP3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chchd5Q9CQP3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chchd5Q9CQP3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chchd5Q9CQP3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chchd5Q9CQP3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chchd5Q9CQP3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd5Q9CQP3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd5Q9CQP3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd5Q9CQP3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd5Q9CQP3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd5Q9CQP3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd5Q9CQP3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd5Q9CQP3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd5Q9CQP3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd5Q9CQP3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chchd5Q9CQP3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms