Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Mrpl35Q9CQL6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl35Q9CQL6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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