Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE6

Asf1a, Histone chaperone ASF1A, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1aQ9CQE6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Asf1aQ9CQE6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Asf1aQ9CQE6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms