Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC8

Spg21, Maspardin, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg21Q9CQC8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spg21Q9CQC8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Spg21Q9CQC8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spg21Q9CQC8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms