Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ubl4bQ9CQ84 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ubl4bQ9CQ84 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ubl4bQ9CQ84 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Ubl4bQ9CQ84 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Ubl4bQ9CQ84 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Ubl4bQ9CQ84 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ubl4bQ9CQ84 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ubl4bQ9CQ84 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ubl4bQ9CQ84 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ubl4bQ9CQ84 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ubl4bQ9CQ84 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ubl4bQ9CQ84 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ubl4bQ9CQ84 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ubl4bQ9CQ84 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ubl4bQ9CQ84 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Ubl4bQ9CQ84 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ubl4bQ9CQ84 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Ubl4bQ9CQ84 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ubl4bQ9CQ84 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ubl4bQ9CQ84 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Ubl4bQ9CQ84 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Ubl4bQ9CQ84 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ubl4bQ9CQ84 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ubl4bQ9CQ84 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ubl4bQ9CQ84 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ubl4bQ9CQ84 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Ubl4bQ9CQ84 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ubl4bQ9CQ84 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ubl4bQ9CQ84 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ubl4bQ9CQ84 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ubl4bQ9CQ84 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ubl4bQ9CQ84 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ubl4bQ9CQ84 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Ubl4bQ9CQ84 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Ubl4bQ9CQ84 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ubl4bQ9CQ84 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ubl4bQ9CQ84 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ubl4bQ9CQ84 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ubl4bQ9CQ84 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ubl4bQ9CQ84 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ubl4bQ9CQ84 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ubl4bQ9CQ84 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ubl4bQ9CQ84 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ubl4bQ9CQ84 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ubl4bQ9CQ84 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ubl4bQ9CQ84 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ubl4bQ9CQ84 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ubl4bQ9CQ84 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ubl4bQ9CQ84 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ubl4bQ9CQ84 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ubl4bQ9CQ84 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Ubl4bQ9CQ84 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Ubl4bQ9CQ84 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ubl4bQ9CQ84 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Ubl4bQ9CQ84 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ubl4bQ9CQ84 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ubl4bQ9CQ84 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ubl4bQ9CQ84 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ubl4bQ9CQ84 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ubl4bQ9CQ84 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Ubl4bQ9CQ84 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ubl4bQ9CQ84 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ubl4bQ9CQ84 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ubl4bQ9CQ84 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ubl4bQ9CQ84 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ubl4bQ9CQ84 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ubl4bQ9CQ84 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ubl4bQ9CQ84 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ubl4bQ9CQ84 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ubl4bQ9CQ84 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ubl4bQ9CQ84 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ubl4bQ9CQ84 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms