Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Efcab2Q9CQ46 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Efcab2Q9CQ46 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Efcab2Q9CQ46 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Efcab2Q9CQ46 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Efcab2Q9CQ46 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Efcab2Q9CQ46 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Efcab2Q9CQ46 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Efcab2Q9CQ46 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Efcab2Q9CQ46 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Efcab2Q9CQ46 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Efcab2Q9CQ46 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Efcab2Q9CQ46 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Efcab2Q9CQ46 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Efcab2Q9CQ46 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Efcab2Q9CQ46 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Efcab2Q9CQ46 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Efcab2Q9CQ46 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Efcab2Q9CQ46 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Efcab2Q9CQ46 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Efcab2Q9CQ46 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Efcab2Q9CQ46 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Efcab2Q9CQ46 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Efcab2Q9CQ46 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Efcab2Q9CQ46 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms