Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NenfQ9CQ45 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NenfQ9CQ45 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NenfQ9CQ45 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NenfQ9CQ45 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NenfQ9CQ45 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NenfQ9CQ45 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NenfQ9CQ45 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NenfQ9CQ45 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NenfQ9CQ45 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NenfQ9CQ45 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NenfQ9CQ45 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NenfQ9CQ45 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NenfQ9CQ45 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NenfQ9CQ45 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NenfQ9CQ45 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NenfQ9CQ45 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NenfQ9CQ45 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NenfQ9CQ45 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NenfQ9CQ45 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms