Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mrpl49Q9CQ40 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl49Q9CQ40 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl49Q9CQ40 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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