Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
StambpQ9CQ26 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms