Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc198Q9CPZ1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc198Q9CPZ1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc198Q9CPZ1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc198Q9CPZ1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms