Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl17Q9CPR4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpl17Q9CPR4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpl17Q9CPR4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpl17Q9CPR4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpl17Q9CPR4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpl17Q9CPR4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpl17Q9CPR4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpl17Q9CPR4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms