Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2a1Q99PM3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2a1Q99PM3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms