Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cep41Q99NF3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cep41Q99NF3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 245 ms