Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rims1Q99NE5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rims1Q99NE5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rims1Q99NE5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms