Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl43Q99N89 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl43Q99N89 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl43Q99N89 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl43Q99N89 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl43Q99N89 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl43Q99N89 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl43Q99N89 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl43Q99N89 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl43Q99N89 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl43Q99N89 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl43Q99N89 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl43Q99N89 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl43Q99N89 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl43Q99N89 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.8 ms