Protein–RNA interactions for Protein: Q99N43

Kremen1, Kremen protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kremen1Q99N43 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kremen1Q99N43 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kremen1Q99N43 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kremen1Q99N43 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kremen1Q99N43 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms