Protein–RNA interactions for Protein: Q99M73

Krt84, Keratin, type II cuticular Hb4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt84Q99M73 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt84Q99M73 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt84Q99M73 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt84Q99M73 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt84Q99M73 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt84Q99M73 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt84Q99M73 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt84Q99M73 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt84Q99M73 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt84Q99M73 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt84Q99M73 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt84Q99M73 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt84Q99M73 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt84Q99M73 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt84Q99M73 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt84Q99M73 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt84Q99M73 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt84Q99M73 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt84Q99M73 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt84Q99M73 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Krt84Q99M73 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt84Q99M73 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms